โรงพยาบาลเกษมราษฎร์ ปราจีนบุรี ได้ผ่านการตรวจรับรองระบบคุณภาพ ISO 9001:2015 มาตรฐานของระบบบริหารคุณภาพ (Quality Management System : QMS) ซึ่งเป็นที่ยอมรับในระดับสากล เป็นระบบที่ใช้สำหรับบริหารกระบวนการให้ได้สินค้าหรือบริการที่มีคุณภาพตรงตามความต้องการของลูกค้าอย่างสม่ำเสมอ